作为古生物领域最重要、藏品最丰富的专业博物馆，古脊椎所和南古所标本馆一直承担着频繁的国际同行接待任务。每年来两个馆参观、观察标本的人数达300人次以上，也接待了很多对古生物有极大兴趣的国外领导人。

土壤标本馆的国际交流活动也十分活跃，与美国、德国、俄罗斯、荷兰、日本等国的土壤博物馆之间经常互采、互赠土壤标本，有着密切的合作关系。馆内收藏有德国、俄罗斯、朝鲜、日本、荷兰等国和我国老、中、青土壤科研人员采集研究的标本。特别是80年代以来与荷兰科学家进行的3次合作，先后在我国采集制作了50个典型土壤整段标本并寄往荷兰，供国际土壤参比中心向全世界展示，受到了国际土壤学界的赞誉。